21世紀初，人口因生物災難而銳減，僅存2類人群：一種是「諾庫斯」，他們感染了病毒卻存活下來，因此體內攜有抗體；另一種則是「久里奧」，他們從未感染過病毒。出生在貧窮村莊的奧寺哲彥，對自己的「久里奧」身分不滿，渴望成為「諾庫斯」。至於他的兒時玩伴生田結衣，則試圖振興貧窮的村莊…